Aristides Eliopoulos

Academic Profile

Aristides G. Eliopoulos is Professor of Biology & Genetics and Director of the Department of Biology at the School of Medicine, National and Kapodistrian University of Athens (NKUA), where he leads an internationally recognised research programme at the intersection of genetics, inflammation, and metabolic health. His work leverages single cell multi-omics and NGS with artificial intelligence to develop personalised therapeutic and nutritional strategies.

Education & Academic Career

Prof. Eliopoulos completed his PhD in Molecular Biology at the University of Crete (1994). He pursued postdoctoral research at the University of Birmingham (1994–1996) and the Institute for Cancer Studies, Birmingham, UK (1996–2000), before establishing his own independent research group (2000–2005). He held a Visiting Researcher position at the Kimmel Cancer Center, Thomas Jefferson University & Tufts NEMC, USA (2001–2002). Returning to Greece, he served as Associate Professor and subsequently Professor at the University of Crete Medical School (2005–2017), with a concurrent appointment as Associate Faculty at IMBB–FORTH, Heraklion. Since 2017, he holds the position of Professor of Biology & Genetics and Head of the Department of Biology at the NKUA School of Medicine.

Research Activities

Prof. Eliopoulos' research philosophy is grounded in the belief that major biomedical advances require interdisciplinary collaboration. His team currently pursues four main research directions. In the area of intestinal pathologies, they investigate molecular pathways and microbiota signatures associated with susceptibility to ulcerative colitis and cancer, using cell lines, organoids, mouse and Drosophila models to uncover epigenetic circuits controlling intestinal stem cell fate. In liver pathologies, his team has identified novel functions of hepatic Apolipoprotein A-I as a suppressor of hepatic steatosis and hepatocellular carcinoma, and has discovered natural compounds with protective effects against fatty liver disease. In obesity & oncology, the lab maps molecular and genetic factors linking obesity to cancer. Finally, in AI & Precision Medicine, his team integrates multi-omic, lifestyle, and nutritional data into AI platforms to advance personalised medicine and nutrition.

Publications & Scientific Impact

Prof. Eliopoulos has authored over 150 peer-reviewed publications in high-impact journals including Nature, Nature Communications, PNAS, EMBO Journal, and Oncogene. He has been invited to present his research in >60 national and international conferences and research institutions.

Innovation

Prof. Eliopoulos holds 5 patents and 3 innovation awards. He is Co-founder and Chief Scientific Officer of Genosophy®, an award-winning NKUA spin-off dedicated to personalised genomic medicine and precision nutrition.

Teaching & Supervision

Prof. Eliopoulos coordinates and teaches Biology and Medical Genetics to undergraduate medical students at NKUA (330–370 students per semester), including the English-language International Medical Programme (40–50 students). He has supervised 11 undergraduate theses, 25 MSc dissertations, and 14 PhD theses in Greece and the UK, and has organised 4 international summer schools on inflammation, cancer, and bioinformatics. He has authored and translated multiple biology and genetics textbooks widely used across Greek medical schools.

Honours & Distinctions

• 2026: NKUA Innovation Award for an anticancer drug development platform
• 2024: 1st Innovation Award, National Bank of Greece Business Seeds Competition for an AI platform in precision medicine and personalized nutrition
• 2023: Innovation Award, NKUA, for an AI platform in precision medicine and personalized nutrition
• 2000: MRC Career Development Award, London, UK
• 1999: MRC Research Fellowship, London, UK
• 1990: PhD Fellowship, National Hellenic Research Foundation

Leadership & Coordination

Prof. Eliopoulos has coordinated 3 high-profile multidisciplinary EC-funded research programmes, including INFLA-CARE (FP7, €12M, 21 teams from Europe and Israel) and the National Flagship Action on infectious lung diseases (€4.7M). He is a member of the Governing Boards of the NKUA Center of Precision Medicine and the Center of Excellence in Agri-Food and Food Authenticity. He has evaluated more than 50 PhD theses and 70 faculty appointments in Greece, UK, Spain, and Sweden, and serves on grant evaluation panels for Horizon EIC, COST and national agencies of Greece, Lithuania, Israel, UK, Hong Kong, Italy, France, Austria, and Qatar.

Ακαδημαϊκό Προφίλ

Ο Αριστείδης Γ. Ηλιόπουλος είναι Καθηγητής Βιολογίας & Γενετικής και Διευθυντής του Τμήματος Βιολογίας της Ιατρικής Σχολής του Εθνικού και Καποδιστριακού Πανεπιστημίου Αθηνών (ΕΚΠΑ), όπου ηγείται διεθνώς αναγνωρισμένου ερευνητικού προγράμματος στα πεδία της γενετικής, της φλεγμονής και της μεταβολικής υγείας. Το έργο του αξιοποιεί τεχνολογίες ομικής σε συνδυασμό με Τεχνητή Νοημοσύνη για την ανάπτυξη εξατομικευμένων θεραπευτικών και διατροφικών στρατηγικών.

Σπουδές & Ακαδημαϊκή Πορεία

Ο Καθ. Ηλιόπουλος ολοκλήρωσε το Διδακτορικό του στη Μοριακή Βιολογία στο Πανεπιστήμιο Κρήτης (1994). Πραγματοποίησε μεταδιδακτορική έρευνα στο Πανεπιστήμιο του Μπέρμιγχαμ (1994–1996) και στο Institute for Cancer Studies, Μπέρμιγχαμ, Ην. Βασίλειο (1996–2000), όπου στη συνέχεια ήταν επικεφαλής ανεξάρτητης ερευνητικής ομάδας (2000–2005). Υπήρξε Επισκέπτης Ερευνητής στο Kimmel Cancer Center, Thomas Jefferson University & Tufts NEMC, ΗΠΑ (2001–2002). Επιστρέφοντας στην Ελλάδα, διετέλεσε Αναπληρωτής και στη συνέχεια Καθηγητής Μοριακής Βιολογίας στην Ιατρική Σχολή Παν/μίου Κρήτης (2005–2017), με παράλληλη θέση ως Συνεργαζόμενο μέλος ΔΕΠ στο ΙΜΒΒ-ΙΤΕ, Ηράκλειο. Από το 2017 κατέχει τη θέση Καθηγητή Βιολογίας & Γενετικής και Διευθυντή του Εργαστηρίου Βιολογίας της Ιατρικής Σχολής ΕΚΠΑ.

Ερευνητικό Έργο

Η ερευνητική φιλοσοφία του Καθ. Ηλιόπουλου βασίζεται στην πεποίθηση ότι οι μεγάλες βιοϊατρικές ανακαλύψεις απαιτούν διεπιστημονική συνεργασία. Η ομάδα του ακολουθεί τέσσερις κύριες ερευνητικές κατευθύνσεις. Στον τομέα των παθολογιών του εντέρου, μελετώνται μοριακά μονοπάτια και υπογραφές μικροβιώματος που σχετίζονται με την ευαισθησία στην ελκώδη κολίτιδα και τον καρκίνο, με χρήση κυτταρικών σειρών, οργανοειδών, καθώς και μοντέλων ποντικού και δροσόφιλας. Στις ηπατικές παθολογίες, η ομάδα έχει ανακαλύψει νέες λειτουργίες της ηπατικής Απολιποπρωτεΐνης Α-Ι ως καταστολέα της ηπατικής στεάτωσης και του ηπατοκυτταρικού καρκινώματος, καθώς και φυσικές ενώσεις με προστατευτική δράση κατά της λιπώδους νόσου του ήπατος. Στον τομέα της παχυσαρκίας, χαρτογραφούνται μοριακοί και γενετικοί παράγοντες που την συνδέουν με τον καρκίνο. Τέλος, στην ΤΝ & Ιατρική Ακριβείας, ενσωματώνονται δεδομένα ομικής, τρόπου ζωής και διατροφής σε πλατφόρμες ΤΝ για την προώθηση της εξατομικευμένης ιατρικής και διατροφής.

Δημοσιεύσεις & Επιστημονική Επίδραση

Ο Καθ. Ηλιόπουλος έχει δημοσιεύσει πάνω από 150 εργασίες σε κορυφαία διεθνή περιοδικά, μεταξύ των οποίων Nature, Nature Communications, PNAS, EMBO Journal και Oncogene. Έχει προσκληθεί να παρουσιάσει το ερευνητικό του έργο σε περισσότερα από 60 εθνικά και διεθνή συνέδρια και ερευνητικά ιδρύματα.

Καινοτομία

Ο Καθ. Ηλιόπουλος κατέχει 5 διπλώματα ευρεσιτεχνίας και έχει λάβει 3 βραβεία καινοτομίας. Είναι Συνιδρυτής και Επιστημονικός Διευθυντής (CSO) της Genosophy®, βραβευμένου τεχνοβλαστού (spin-off) του ΕΚΠΑ αφιερωμένου στην εξατομικευμένη γονιδιωματική ιατρική και την ιατρική ακριβείας.

Διδασκαλία & Επίβλεψη

Ο Καθ. κ. Ηλιόπουλος διδάσκει Βιολογία και Ιατρική Γενετική σε προπτυχιακούς φοιτητές Ιατρικής του ΕΚΠΑ (330–370 φοιτητές ανά εξάμηνο), συμπεριλαμβανομένου του Αγγλόφωνου Διεθνούς Προγράμματος Ιατρικής ΕΚΠΑ (40–50 φοιτητές). Έχει επιβλέψει 11 προπτυχιακές εργασίες, 25 μεταπτυχιακές διατριβές και 14 διδακτορικές διατριβές στην Ελλάδα και το Ην. Βασίλειο, και έχει διοργανώσει 4 διεθνή θερινά σχολεία για τη φλεγμονή, τον καρκίνο και τη βιοπληροφορική. Έχει συγγράψει και μεταφράσει πολλά εγχειρίδια Βιολογίας και Γενετικής που χρησιμοποιούνται ευρέως στις Ιατρικές Σχολές της Ελλάδας.

Διακρίσεις & Βραβεία

• 2026: Βραβείο Καινοτομίας ΕΚΠΑ για πλατφόρμα ανάπτυξης αντικαρκινικών φαρμάκων
• 2024: 1ο Βραβείο Καινοτομίας, Διαγωνισμός Business Seeds Εθνικής Τράπεζας Ελλάδος, για πλατφόρμα ΤΝ στην ιατρική ακριβείας και εξατομικευμένη διατροφή
• 2023: Βραβείο Καινοτομίας ΕΚΠΑ για πλατφόρμα ΤΝ στην ιατρική ακριβείας και εξατομικευμένη διατροφή
• 2000: MRC Career Development Award, Λονδίνο, ΗΒ
• 1999: MRC Research Fellowship, Λονδίνο, ΗΒ
• 1990: Υποτροφία Διδακτορικής Έρευνας, Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών

Διοικητικό Έργο

Ο Καθ. Ηλιόπουλος έχει συντονίσει 3 πολυεπιστημονικά ερευνητικά προγράμματα της ΕΕ, μεταξύ των οποίων το INFLA-CARE (FP7, €12εκ., 21 ομάδες από Ευρώπη και Ισραήλ) και την Εθνική Εμβληματική Δράση για τα λοιμώδη νοσήματα του πνεύμονα (€4,7εκ.). Είναι μέλος των Διοικητικών Συμβουλίων του Κέντρου Ιατρικής Ακριβείας και του Κέντρου Αριστείας Αγροδιατροφής του ΕΚΠΑ. Έχει αξιολογήσει πάνω από 50 διδακτορικές διατριβές και 70 ακαδημαϊκές θέσεις σε Ελλάδα, Ην. Βασίλειο, Ισπανία και Σουηδία, και συμμετέχει σε επιτροπές αξιολόγησης του Horizon EIC, COST και εθνικών φορέων χρηματοδότησης Ελλάδας, Λιθουανίας, Ισραήλ, Ην. Βασιλείου, Χονγκ Κονγκ, Ιταλίας, Γαλλίας, Αυστρίας και Κατάρ.

Current Position

Postdoctoral Researcher, Department of Biology, Medical School, NKUA (January 2025–present). Recipient of a highly competitive Marie Skłodowska-Curie Postdoctoral Fellowship (May 2026–2028).

Education

PhD in Molecular Biology, Aristotle University of Thessaloniki (2013–2018, grade: Excellent) — Thesis: Functional role of CYLD tumour suppressor in breast cancer.
MSc Applied Genetics & Biotechnology, AUTH (2010–2013, grade: 9.28/10).
BSc Biology, AUTH (2006–2010, grade: 8.82/10).

Previous Positions

Postdoctoral Research Fellow, Dept. of Experimental Oncology, Vita-Salute San Raffaele University, Milan (Feb 2019 – Dec 2024) — CYLD tumour suppressor in B-cell maturation and splenic marginal zone lymphoma.
Postdoctoral Researcher, Aristotle University of Thessaloniki (Mar 2018 – Jan 2019).

Fellowships & Awards

• Marie Skłodowska-Curie Postdoctoral Fellowship, Horizon Europe (2026–2028)
• AIRC Postdoctoral Fellowship, Italy (2023–2025) — €70,000
• iCARE-2 Fellowship co-funded by AIRC & Horizon 2020 / MSCA (2019–2022) — €174,000
• Onassis Foundation Scholarship for PhD studies (2015–2018)
• Invited guest of the President of Italy at the Presidential Palace — Day for Cancer Research (2019)

Selected Publications

• Pseftogas A et al. Loss of CYLD promotes splenic marginal zone lymphoma. HemaSphere 2025.
• Pseftogas A et al. Inactivation of CYLD sensitizes mice to breast cancer. Anticancer Res 2024.
• Bordini J, …, Pseftogas A et al. IκBε deficiency accelerates CLL development. Leukemia 2024.
• Pseftogas A et al. CYLD inhibits EMT by coordinated inhibition of YAP/TAZ and TGFβ. Cancers 2020.
• Pseftogas A et al. PPARγ activation upregulates CYLD to mediate growth inhibition. IJBCB 2017.

Τρέχουσα Θέση

Μεταδιδακτορικός Ερευνητής, Εργαστήριο Βιολογίας, Ιατρική Σχολή, ΕΚΠΑ (Ιανουάριος 2025–σήμερα). Κάτοχος της ανταγωνιστικής Υποτροφίας MSCA Postdoctoral Fellowship (Μάιος 2026–2028).

Σπουδές

Διδακτορικό, Τμήμα Βιολογίας, ΑΠΘ (2013–2018, βαθμός: Άριστα).
MSc Εφαρμοσμένη Γενετική & Βιοτεχνολογία, ΑΠΘ (2010–2013, βαθμός: 9,28/10).
Πτυχίο Βιολογίας, ΑΠΘ (2006–2010, βαθμός: 8,82/10).

Προηγούμενες Θέσεις

Μεταδιδακτορικός Ερευνητής, Τμήμα Πειραματικής Ογκολογίας, Vita-Salute San Raffaele University, Μιλάνο (Φεβρουάριος 2019 – Δεκέμβριος 2024) — CYLD σε λέμφωμα σπληνικής οριακής ζώνης.
Μεταδιδακτορικός Ερευνητής, ΑΠΘ (Μάρτιος 2018 – Ιανουάριος 2019).

Υποτροφίες & Διακρίσεις

• Υποτροφία Marie Skłodowska-Curie Postdoctoral Fellowship, Horizon Europe (2026–2028)
• Υποτροφία AIRC, Ιταλία (2023–2025) — €70.000
• Υποτροφία iCARE-2, AIRC & Horizon 2020 / MSCA (2019–2022) — €174.000
• Υποτροφία Ιδρύματος Ωνάση για διδακτορικές σπουδές (2015–2018)
• Προσκεκλημένος στο Προεδρικό Μέγαρο Ιταλίας — Ημέρα Έρευνας για τον Καρκίνο (2019)

Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις

• Pseftogas A et al. Loss of CYLD promotes splenic marginal zone lymphoma. HemaSphere 2025.
• Pseftogas A et al. Inactivation of CYLD sensitizes mice to breast cancer. Anticancer Res 2024.
• Bordini J, …, Pseftogas A et al. IκBε deficiency accelerates CLL development. Leukemia 2024.
• Pseftogas A et al. CYLD inhibits EMT by coordinated inhibition of YAP/TAZ and TGFβ. Cancers 2020.

Current Position

Postdoctoral Researcher, Biology Laboratory, Medical School, National and Kapodistrian University of Athens (NKUA), under the supervision of Prof. Aristides Eliopoulos. Research focus: molecular haematology, immuno-oncology and single-cell multi-omics approaches to understand gene regulation and identify novel diagnostic biomarkers and molecular therapies.

Education

D.Phil. (PhD), Dept. of Oncology, University of Oxford (2014–2019) — TNFR1-selective permeabilisation of the blood-brain barrier in brain metastasis. Scholarships: Clarendon, New College, A.G. Leventis.
M.Res. Clinical Research, Imperial College London (2013–2014). Scholarships: Onassis Foundation, A.G. Leventis.
BSc Molecular Biology & Genetics, Democritus University of Thrace (2008–2012).

Research Interests

Molecular haematology · Immuno-oncology · Single-cell multi-omics · Novel diagnostics and molecular therapies · Chromatin organisation.

Fellowships & Awards

• Clarendon Scholarship, University of Oxford (2014–2018) — £24,421
• New College Scholarship, University of Oxford (2014–2018) — £20,750
• Onassis Foundation Scholarship for M.Res. studies (2013–2014) — £20,000
• A.G. Leventis Foundation Scholarship for M.Res. & D.Phil. (2013–2016) — £14,000
• Young Investigator Award, Guarantors of Brain (2019) — £1,000
• Best Poster Award, European Association of Neuro-Oncology (EANO) (2017)

Selected Publications

• Simoglou Karali C et al. A Multiomic Single-Cell Atlas of Human Myelopoiesis Reveals Drivers of IMiD-Induced Neutropenia. Under revision.
• Khan AO, …, Simoglou Karali C et al. Human Bone Marrow Organoids for Hematologic Malignancies. Cancer Discov 2023.
• Sousos N, …, Simoglou Karali C et al. In utero origin of myelofibrosis in adult monozygotic twins. Nat Med 2022.
• COMBAT Consortium (incl. Simoglou Karali C). A blood atlas of COVID-19. Cell 2022.
• Munoz Pinto MF, …, Simoglou Karali C et al. Selective BBB permeabilization in brain metastases. Neuro-Oncol 2022.

Τρέχουσα Θέση

Μεταδιδακτορική Ερευνήτρια, Εργαστήριο Βιολογίας, Ιατρική Σχολή, Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ), υπό την επίβλεψη του Καθ. Αριστείδη Ηλιόπουλου. Ερευνητικό αντικείμενο: μοριακή αιματολογία, ανοσο-ογκολογία και πολυωμικές αναλύσεις μοναδιαίων κυττάρων για τη μελέτη γονιδιακής ρύθμισης και την ανακάλυψη νέων διαγνωστικών βιοδεικτών και μοριακών θεραπειών.

Σπουδές

D.Phil. (Διδακτορικό), Τμήμα Ογκολογίας, Πανεπιστήμιο Οξφόρδης (2014–2019) — Εκλεκτική διαπερατοποίηση αιματοεγκεφαλικού φραγμού μέσω TNFR1. Υποτροφίες: Clarendon, New College, Α.Γ. Λεβέντης.
M.Res. Κλινική Έρευνα, Imperial College London (2013–2014). Υποτροφίες: Ίδρυμα Ωνάση, Α.Γ. Λεβέντης.
Πτυχίο Μοριακής Βιολογίας & Γενετικής, Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης (2008–2012).

Ερευνητικά Ενδιαφέροντα

Μοριακή αιματολογία · Ανοσο-ογκολογία · Πολυωμικές αναλύσεις μοναδιαίων κυττάρων · Νέοι διαγνωστικοί δείκτες και μοριακές θεραπείες.

Υποτροφίες & Διακρίσεις

• Υποτροφία Clarendon, Πανεπιστήμιο Οξφόρδης (2014–2018) — £24.421
• Υποτροφία New College, Πανεπιστήμιο Οξφόρδης (2014–2018) — £20.750
• Υποτροφία Ιδρύματος Ωνάση για M.Res. (2013–2014) — £20.000
• Υποτροφία Ιδρύματος Α.Γ. Λεβέντη για M.Res. & D.Phil. (2013–2016) — £14.000
• Βραβείο Νέου Ερευνητή, Guarantors of Brain (2019) — £1.000
• Βραβείο Καλύτερης Αναρτημένης Ανακοίνωσης, ΕΑΝΟ (2017)

Επιλεγμένες Δημοσιεύσεις

• Simoglou Karali C et al. Πολυωμικός Άτλας Μυελοποίησης — Μηχανισμοί Ουδετεροπενίας από IMiDs. Υπό επεξεργασία.
• Khan AO, …, Simoglou Karali C et al. Human Bone Marrow Organoids. Cancer Discov 2023.
• Sousos N, …, Simoglou Karali C et al. Ενδομήτρια προέλευση μυελοΐνωσης. Nat Med 2022.
• COMBAT Consortium (incl. Simoglou Karali C). Αιματολογικός άτλας COVID-19. Cell 2022.
• Munoz Pinto MF, …, Simoglou Karali C et al. Εκλεκτική διαπερατοποίηση ΑΕΦ. Neuro-Oncol 2022.

Current Position

PhD Candidate, Biology Laboratory, Medical School, NKUA & Biomedical Sciences Research Center 'Alexander Fleming' (2023–present). Supervisors: Prof. Aristides Eliopoulos & Dr. Maria Fousteri. Thesis: Integrative bioinformatic approaches for gene regulation and chromatin organisation.

Education

MSc Data Science & Information Technologies: Bioinformatics – Biomedical Data Science, NKUA (2020–2023).
BSc Computer Science: Databases & Knowledge Management, Athens University of Economics and Business (2012–2019).

Research Experience

Bioinformatician, Biomedical Sciences Research Center 'Alexander Fleming', Fousteri Lab (2019–2023).
Research Intern, BSRC 'Alexander Fleming' (2018–2019).
Visiting International Scholar, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, USA (2024–2025) — Hi-C data analysis on schizophrenia datasets.

Fellowships

• 5th Call HFRI Scholarship for PhD Candidates (2024–2027)
• Bodossaki Foundation Scholarship for Visiting Research Scientists (2024–2025)

Technical Expertise

Python, R, Bash, Java · Multi-omic NGS: RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, Hi-C, GRO-seq, scRNA-seq · Statistical modelling: DESeq2, linear mixed models · Tools: Seurat, Scanpy, cooltools, BEDTools, SAMtools.

Selected Publications

• Liakos A., Synacheri A.-C. et al. Enhanced transcription pre-initiation complex assembly after UV irradiation reduces mutagenesis. Nucleic Acids Research 2023.
• Fanourgakis S., Synacheri A.-C. et al. H2Bub1 dynamics in 5' region of active genes linked to UV-induced transcriptional response. Comp Struct Biotech J 2022.

Τρέχουσα Θέση

Υποψήφια Διδάκτορας, Εργαστήριο Βιολογίας, Ιατρική Σχολή ΕΚΠΑ & Ερευνητικό Κέντρο Βιοϊατρικών Επιστημών 'Αλέξανδρος Φλέμινγκ' (2023–σήμερα). Επιβλέποντες: Καθ. Αριστείδης Ηλιόπουλος & Δρ. Μαρία Φουστέρη. Διατριβή: Ανάπτυξη ολοκληρωμένων βιοπληροφορικών προσεγγίσεων για τη μελέτη γονιδιακής ρύθμισης και χρωματινικής οργάνωσης.

Σπουδές

Μεταπτυχιακό Επιστήμη Δεδομένων & Τεχνολογίες Πληροφορίας: Βιοπληροφορική – Επιστήμη Βιοϊατρικών Δεδομένων, ΕΚΠΑ (2020–2023).
Πτυχίο Πληροφορικής: Βάσεις Δεδομένων & Διαχείριση Γνώσης, ΟΠΑ (2012–2019).

Ερευνητική Εμπειρία

Βιοπληροφορικός, ΕΚΒΕ 'Αλέξανδρος Φλέμινγκ', Εργαστήριο Φουστέρη (2019–2023).
Ερευνητική Πρακτική, ΕΚΒΕ 'Αλέξανδρος Φλέμινγκ' (2018–2019).
Επισκέπτρια Ερευνήτρια, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, ΗΠΑ (2024–2025) — Ανάλυση Hi-C δεδομένων σχιζοφρένειας.

Υποτροφίες

• 5η Προκήρυξη Υποτροφιών ΕΛΙΔΕΚ για Υποψήφιους Διδάκτορες (2024–2027)
• Υποτροφία Ιδρύματος Μποδοσάκη για Επισκέπτες Ερευνητές (2024–2025)

Τεχνική Εξειδίκευση

Python, R, Bash, Java · Πολυ-ομικές αναλύσεις NGS: RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, Hi-C, GRO-seq, scRNA-seq · Στατιστική μοντελοποίηση: DESeq2, γραμμικά μεικτά μοντέλα · Εργαλεία: Seurat, Scanpy, cooltools, BEDTools, SAMtools.

Δημοσιεύσεις

• Liakos A., Synacheri A.-C. et al. Αυξημένη συναρμολόγηση συμπλόκων προ-έναρξης μεταγραφής μετά από UV. Nucleic Acids Research 2023.
• Fanourgakis S., Synacheri A.-C. et al. Δυναμική H2Bub1 στην 5' περιοχή ενεργών γονιδίων. Comp Struct Biotech J 2022.

Education & Training

Positions

Honours & Awards

• 2024: 1st Innovation Award, National Bank of Greece Business Seeds Competition (ML algorithm in Healthcare)
• 2023: Innovation Award of NKUA for a machine learning algorithm in Healthcare
• 2000: MRC Career Development Award, London, UK
• 1999: MRC Research Fellowship, London, UK
• 1990: PhD Fellowship, National Hellenic Research Foundation

Research

Research spans intestinal and liver pathologies, genetics & nutrition, and AI-driven precision medicine. Current projects include: epigenetic circuits controlling intestinal stem cell fate; hepatic apolipoprotein A-I as suppressor of steatosis and hepatocellular carcinoma; genetics-based nutritional recommendations to modify microbiota signatures.

150+ publications · 28,500+ citations · h-index = 64 · 5 patents

Supervision

Supervisor of 11 undergraduate theses, 25 MSc dissertations, and 14 PhD theses in Greece and the UK. Organiser of 4 international summer schools on inflammation, cancer, and bioinformatics.

Innovation & Leadership

Co-founder & CSO of Genosophy® (NKUA spin-off, 2023–present). Coordinator of 3 EC-funded multidisciplinary research programmes (incl. INFLA-CARE FP7, €12M). Head of Department of Biology, NKUA (2017–present). Member of the Governing Boards of the NKUA Center of Precision Medicine and the Center of Excellence in Agri-Food.

Σπουδές & Εκπαίδευση

Θέσεις

Διακρίσεις & Βραβεία

• 2024: 1ο Βραβείο Καινοτομίας, Εθνική Τράπεζα Ελλάδος (Business Seeds) για αλγόριθμο μηχανικής μάθησης στην Υγεία
• 2023: Βραβείο Καινοτομίας ΕΚΠΑ για αλγόριθμο μηχανικής μάθησης στην Υγεία
• 2000: MRC Career Development Award, Λονδίνο, ΗΒ
• 1999: MRC Research Fellowship, Λονδίνο, ΗΒ
• 1990: Υποτροφία Διδακτορικής Έρευνας, Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών

Έρευνα

Η έρευνά του καλύπτει εντερικές και ηπατικές παθολογίες, γενετική & διατροφή, και ιατρική ακριβείας με χρήση ΤΝ. Τρέχοντα προγράμματα περιλαμβάνουν: επιγενετικοί μηχανισμοί ελέγχου εντερικών βλαστοκυττάρων· ρόλος της ηπατικής Απολιποπρωτεΐνης Α-Ι ως καταστολέα στεάτωσης και ηπατοκυτταρικού καρκινώματος· διατροφικές συστάσεις βασισμένες στη γενετική για τροποποίηση του μικροβιώματος.

150+ δημοσιεύσεις · 28.500+ ετεροαναφορές · h-index = 64 · 5 διπλώματα ευρεσιτεχνίας

Επίβλεψη

Επιβλέπων 11 προπτυχιακών εργασιών, 25 μεταπτυχιακών διατριβών και 14 διδακτορικών διατριβών στην Ελλάδα και το ΗΒ. Διοργανωτής 4 διεθνών θερινών σχολείων σε θέματα φλεγμονής, καρκίνου και βιοπληροφορικής.

Καινοτομία & Ηγεσία

Συνιδρυτής & Επιστημονικός Διευθυντής της Genosophy® (τεχνοβλαστός ΕΚΠΑ, 2023–σήμερα). Συντονιστής 3 πολυεπιστημονικών ερευνητικών προγραμμάτων ΕΕ (συμπ. INFLA-CARE FP7, €12εκ.). Διευθυντής Τμήματος Βιολογίας ΕΚΠΑ (2017–σήμερα). Μέλος Διοικητικών Συμβουλίων του Κέντρου Ιατρικής Ακριβείας και του Κέντρου Αριστείας Αγροδιατροφής ΕΚΠΑ.